曹洞宗中本山であり、七堂伽藍を有する寺院。
関ヶ原の戦いに際し6世住持の大渓は田辺城に籠城した細川幽斎を支援し、その功績に対し仏涅槃図や梵鐘が細川家から寄進された。

天香山桂林寺は京都府舞鶴市字紺屋に境内を構えている曹洞宗の寺院です。
桂林寺の創建は不詳ですが、古墳時代の565年（欽明天皇26年）に勅願によって薬師寺（やくしじ）として創建されたのが始まりと伝えられています。また桂林寺は室町時代の1401年（応永8年）に竺翁雄仙和尚（ちくおうゆうせんおしょう）が創建したとも言われています。その後1451年（宝徳3年）に佐武ヶ獄城（さぶがたけじょう）城主・坂根修理亮（さかねしゅうりのすけ）が父・桂林院の菩提を弔う為に堂宇を建立し、寺領30石を寄進したことから寺号を桂林寺に改めたと言われています。1600年（慶長5年）の関ヶ原の戦いの際、桂林寺6世住持・大渓（たいけい）が丹後田辺城（たんごたなべじょう）に籠城した細川幽斎（ほそかわゆうさい・細川藤孝（ほそかわふじたか））を支援し、その後細川家から仏涅槃図・梵鐘が寄進されました。細川幽斎は二条流の歌道伝承者・三条西実枝（さんじょうにしさねき）から古今和歌集の解釈を秘伝として師から弟子に伝える古今伝授（こきんでんじゅ）を受けていたことから第107代・後陽成天皇が勅使を派遣し、講和を命じました。2001年（平成13年）に開創600年記念事業として、本堂の屋根が葺き替えられました。なお桂林寺は本尊・阿弥陀如来を安置しています。